沈林園 更新日期:2023-11-15
沈林園,男,1987年出生,学硕导师
工作单位 动物科技学院
单位电话 19934589815
电子邮箱 shenlinyuan0815@163.com
招生专业 【学硕】:090501动物遗传育种与繁殖,【专硕】:095133畜牧
◆个人简历
沈林園,男,汉族,籍贯四川广安,中国党员,博士。2008年-2018年先后在四川农业大学动物科技学院完成动物遗传育种与繁殖专业的本硕博学位学习。于2016-2018年获得国家留学基金委资助在美国伊利诺伊香槟分校进行博士联合培养学习,主要从事参与DNA损伤修复通路中的蛋白功能研究。先后获得六次研究生一等学业奖学金,两次普爱奖学金,博士生国家奖学金,四川省优秀毕业研究生,校级优秀博士论文,四川省科技进步一等奖、四川省科技进步二等奖、全国农牧渔丰收二等奖等奖项。主持国家自然科学基金项目、国家重点研发子课题、四川省重大科技专项子课题、四川省科技厅应用基础项目等10项。作为骨干成员参与了国家重要研发、国家科技支撑、“十三五”和“十四五”育种攻关等项目。2018年12月进入四川农业大学动物科技学院工作至今,主要从事一些典型的非编码RNA(miRNAs, lncRNAs,circRNAs)在猪的脂肪沉积和肌肉肉质性状上的遗传机制的研究工作。以第一作者和通信作者(含并列)在Journal of Cachexia, Sarcopenia and Muscle、Journal of Nanobiotechnology、International Journal of Biological Sciences、Meat Science等杂志上发表SCI论文70余篇,累计影响因子300+,单篇最高IF:12.063,IF>10论文4篇。作为客座编辑主持Genes、Biology等杂志期刊的专刊,担任FEBS Letters, Frontiers in Genetics, Frontiers in Neuroscience,Current Molecular Medicine等SCI杂志审稿专家。
◆工作经历
2018.12-2021.11,四川农业大学,动物遗传育种研究所,讲师
2021.12-至今,四川农业大学,动物遗传育种研究所,副教授
◆教育经历
2016.9–2018.9, 伊利诺伊香槟分校, 细胞与分子生物学,博士联合培养, 导师: Supriya
2014.9–2018.12, 四川农业大学, 动物遗传育种与繁殖, 博士, 导师: 朱砺
2012.9–2014.6, 四川农业大学, 动物遗传育种与繁殖, 硕士, 导师: 朱砺
2008.9–2012.6, 四川农业大学, 动物科学, 学士, 导师:朱庆
◆获奖荣誉
四川省科技进步一等奖;四川省科技进步二等奖;全国农牧渔丰收二等奖;四川省海外高层次留学人才;博士生国家奖学金;四川省优秀毕业研究生;校级优秀博士学位论文等
◆社会、学会及学术兼职
中国畜牧兽医学会动物遗传育种学分会会员、四川省畜牧兽医学会养猪学分会理事
◆研究领域
猪重要经济性状(肉质、繁殖、抗逆等)遗传调控机制研究;非编码RNA的表观遗传调控;功能基因组学。
◆科研项目
1.tRNA m7G修饰介导tRFs生物发生在IUGR猪肌肉代谢综合征中的机制研究 (32372844),国家自然科学基金面上项目,2024.01-2022.12,在研,主持
2.tRNA碎片对IUGR仔猪肌肉代谢综合征的表观调控 (31902135),国家自然科学基金青年项目,2020.01-2022.12,在研,主持
3.主要引进猪种种质资源系统评价与优异种质资源精准鉴定 (2021YFD1200801),国家重点研发计划子课题,2021.12-2026.11,在研,主持
4.tRFs通过竞争miRNAs/circRNAs绑定位点调控猪脂肪沉积的分子机制研究(21YYJC1801),四川省科技厅基础研究项目,2021.04-2023.03,在研,主持
5.tRFs参与IUGR仔猪肌肉蛋白合成受阻的分子调控机制研究(21516),养猪科学重庆市市级重点实验室开发课题,2021.01-2021.12,在研,主持
◆发表论文
1.Linyuan Shen, Tianci Liao, Qiuyang Chen, Yuhang Lei, Linghui Wang, Hao Gu, Yanhao Qiu, Ting Zheng, Yiting Yang, Chenggang Wei, Lei Chen, Ye Zhao, Lili Niu, Shunhua Zhang, Yan Zhu, Mingzhou Li, Jinyong Wang, Xuewei Li, Mailin Gan, Li Zhu; tRNA-derived small RNA, 5′tiRNA-Gly-CCC, promotes skeletal muscle regeneration through the inflammatory response, Journal of Cachexia, Sarcopenia and Muscle, 2023, 2:13187.(IF=12.063,第一作者)
2.Linghui Wang, Yanhao Qiu, Hao Gu, Mailin Gan, Yan Zhu, Kangping Zhu, Lei Chen, Ye Zhao, Lili Niu, Shunhua Zhang, Xuewei Li, Li Zhu, Linyuan Shen; Regulation of Adipose Thermogenesis and its Critical Role in Glucose and Lipid Metabolism, International Journal of Biological Sciences, 2022, 18(13):4950-4962.(IF=10.75, 通信作者)
3.Linyuan Shen; Tianci Liao; Jingyun Chen; Jianfeng Ma; Jinyong Wang; Lei Chen; Shunhua Zhang; Ye Zhao; Lili Niu; Changjun Zeng; Mailin Gan; Li Zhu; Genistein promotes skeletal muscle regeneration by regulating miR-221/222, International Journal of Molecular Sciences, 2022,23:13482.(IF=6.208,第一作者)
4.Linyuan Shen; Mailin Gan; Lei Chen; Ye Zhao; Lili Niu; Guoqing Tang; Yanzhi Jiang; Tinghuan Zhang; Shunhua Zhang; Li Zhu; miR-152 targets pyruvate kinase to regulate the glycolytic activity of pig skeletal muscles and affects pork quality, Meat Science, 2022, 185:108707.(IF=5.209,第一作者)
5.Shen L, He J, Zhao Y, et al. MicroRNA-126b-5p Exacerbates Development of Adipose Tissue and Diet-Induced Obesity[J]. International Journal of Molecular Sciences, 2021, 22(19): 10261.(IF=5.92,第一作者)
6. L.Y. Shen, Z.D. Tan, M.L. Gan, et al. tRNA-Derived Small Non-Coding RNAs as Novel Epigenetic Molecules Regulating Adipogenesis [J]. Biomolecules, 2019, 9(7): 274. (IF=4.694,第一作者)
7. L.Y. Shen, M.L. Gan, Q.Z. Tang, et al. Comprehensive Analysis of lncRNAs and circRNAs Reveals the Metabolic Specialization in Oxidative and Glycolytic Skeletal Muscles [J]. International journal of molecular sciences, 2019, 20(12): 2855. (IF=4.183,第一作者)
8. L.Y. Shen, S.H. Zhang, Q. Li, et al. The Landscape of Non-Coding RNA in an Adult Pig Model of Intrauterine Growth Restriction [J]. Cellular Physiology and Biochemistry, 2018, 50:1764-1778. (IF=5.5, 第一作者)
9. L.Y. Shen, M.L. Gan, S.H. Zhang, et al. Transcriptome Analyses Reveal Adult Metabolic Syndrome With Intrauterine Growth Restriction in Pig Models [J]. Frontiers in genetics, 2018, 9:291. (IF=4.2, 第一作者)
10. L.Y. Shen, M.L. Gan, Q. Li, et al. MicroRNA-200b regulates preadipocyte proliferation and differentiation by targeting KLF4. Biomedicine & Pharmacotherapy. 2018, 103, 1538-1544. (IF=3.5, 第一作者)
11. L.Y. Shen, M.L. Gan, Z.D. et al. A Novel Class of tRNA-Derived Small Non-Coding RNAs Respond to Myocardial Hypertrophy and Contribute to Intergenerational Inheritance. Biomolecules, 2018, 8, 54. 8030054. (IF=4.694, 第一作者)
12. L.Y. Shen, J.J. Du, Y.D Xia, et al. Genome-wide landscape of DNA methylomes and their relationship with mRNA and miRNA transcriptomes in oxidative and glycolytic skeletal muscles. Scientific Reports. 2016, 6: 32186. (SCI收录, IF=5.2, 第一作者)
13. L.Y. Shen, L. Chen, S.H. Zhang, et al.. MicroRNA-27b regulates mitochondria biogenesis in myocytes. PloS one, 2016, 11(2): e0148532. (IF=3.1, 第一作者)
14. L.Y. Shen, J. Luo, J.J. Du, et al. Transcriptome analysis of Liangshan pig muscle development at the growth curve inflection point and asymptotic stages using digital gene expression profiling. Plos One. 2015, 10(8): e0135978. (IF=3.2, 第一作者)
15. L.Y. Shen, L. Chen, S.H. Zhang, et al. MicroRNA-23a regulates slow myosin heavy chain isoforms composition through myocyte enhancer factor 2C (MEF2C) and influences pork quality. Meat science, 2016, 116: 201-206. (IF=2.8, 第一作者)
◆教学活动
指导本科生大学生创新训练计划项目(国家级)1项,本科生科研兴趣培养计划项目(校级)2项,四川省挑战杯银奖2项,四川省互联网+铜奖1项。第三届全国大学生动物科学专业技能大赛团体特等奖指导老师。
◆指导学生
协助指导博士研究生4名,硕士研究生27名。
◆我的团队
隶属于一只由17名固定研究人员组成的“猪分子遗传育种”创新团队,本团队于2013年获得教育部创新团队称号,2015年获得四川省青年科技创新研究团队项目资助。本团队目前拥有教授6人、副教授2人、博导5人、硕导6人、海外知名高校留学经历6人。依托于国家211重点建设学科、国家重点 (培育) 学科、省重点实验室、省2011协同创新中心等平台,每年招收培养硕士、博士研究生20余名。现有在读博士生12人、硕士生26人、在站博士后6人。近年来,本团队围绕四川丰富的优良地方猪种资源,开展了“猪遗传资源的发掘与评价”、“猪重要经济性状形成的分子基础与遗传调控”等为内容的研究。经过近些年的努力和拓展,在国内外具有一定影响力的。